Uryu Kamihate es un estudiante de secundaria que espera matricularse en la facultad de medicina de la Universidad de Kioto. El sacerdote jefe del santuario Amagami le da un hogar y le dice que debe casarse con una de las tres jóvenes hermanas sacerdotisa del templo, Yae, Yuna o Asahi, si quiere seguir viviendo en el santuario Amagami y heredarlo algún día. Kamihate tendrá que conquistar a una de las jóvenes en esta historia de romance, amistad y diversión.